بیماری‌های ناحیه مقعد، به ویژه درد و خونریزی، از شایع‌ترین مشکلات بهداشتی هستند. در بررسی خونریزی مقعدی، دو عامل اصلی باید مد نظر قرار گیرد: رنگ خون و وجود یا عدم درد. خونریزی می‌تواند ناشی از مشکلات دستگاه گوارش فوقانی باشد که در این صورت خون به شکل قیر سیاه و چسبنده دفع می‌شود. اگر خونریزی از ناحیه مقعد به صورت قرمز و همراه با اجابت مزاج دردناک باشد، معمولاً به علت شقاق (فیشر) است.

بواسیر یا هموروئید، واریس شبکه وریدی مقعد است که در ابتدا علامتی ندارد، اما در صورت بروز عارضه، خونریزی بدون درد به شکل پاشش خون در کاسه توالت مشاهده می‌شود. هموروئید به دو نوع داخلی و خارجی تقسیم می‌شود. هموروئید داخلی معمولاً بدون درد است، در حالی که هموروئید خارجی ممکن است به شکل برجستگی در لبه مقعد دیده شود و در صورت ترومبوز، دردناک می‌شود.

شقاق، که به دلیل تنگی مادرزادی مقعد ایجاد می‌شود، علامت اصلی‌اش درد در حین اجابت مزاج است و ممکن است خونریزی خفیفی نیز داشته باشد. این بیماری ارتباطی با یبوست ندارد و در صورت پیشرفت، نیاز به جراحی دارد. در جراحی، تنگی مادرزادی اصلاح می‌شود و زائده‌های پوستی (اسکین تگ) که ممکن است در اطراف شقاق ایجاد شوند، معمولاً دست نخورده باقی می‌مانند.